卓文萱在其著作《GENIE卓文萱1986の獨立萱言》中寫到,2005年,19歲的卓文萱與比自己相差大十四歲的吉他手楊聲錚戀愛,后二人分手。2021年3月20日,卓文萱在接受某媒體專訪時,承認自己與小6歲的男演員許少瑜的戀情,并坦言兩人已經交往一年多,狀態(tài)穩(wěn)定。卓文萱可愛萱萱2010年卓文萱北京演唱會
2008年11月9日,擔任雨天街頭募款代言人,紅心字會公益大使,為弱勢兒童在街頭募款；12月13日,參加由肯愛協(xié)會主辦的“第三屆擁抱愛：忘憂880用愛抱抱您”活動,并擔任臺北關懷憂郁癥患者活動代言人,呼吁民眾關懷憂郁癥患者。2009年6月9日,擔任《讓愛轉動整個宇宙》群星代言人,并錄制了一首公益歌曲《讓愛轉動整個宇宙》來紀念并見證臺灣人在臺灣九·二一地震災難過后堅強的生命力。2010年1月,卓文萱前往紅心字會老人服務中心探視失智老人,并在慶生會現(xiàn)場,將專輯銷售所得的六十萬元捐款給弱勢家庭；3月,與餐飲店連手做公益,為貧童籌募營養(yǎng)餐費。2012年11月20日,參加某品牌與臺灣世界展望會合作舉辦的“用最濃的愛擁抱全世界”愛心募集成果記者會,并捐出10頂“Genie親筆簽名變身潮流帽”提供義賣,希望能透過愛心義賣,倡導并推動公益。2013年,赴越南舉辦“愛在越南甜心卓文萱,甜心演唱會”,為越南故鄉(xiāng)人道孤兒院籌募社會資源,關懷當?shù)厝鮿輧和?/p>