801潛艇遠(yuǎn)航開(kāi)始，所有學(xué)員們都帶著親人、朋友還有愛(ài)人的牽掛再次遠(yuǎn)航，這將是一次時(shí)間與耐力的考驗(yàn)，對(duì)于所有人來(lái)說(shuō)都是一場(chǎng)自己與自己的戰(zhàn)斗。潛艇根據(jù)指示已經(jīng)進(jìn)入預(yù)定航道，在進(jìn)行測(cè)試過(guò)程中，潛艇員匯報(bào)五艙出現(xiàn)了液壓系統(tǒng)故障，尚堂(王陽(yáng) 飾)請(qǐng)示前去查看，等尚堂到了五艙查看發(fā)現(xiàn)，液壓系統(tǒng)是因?yàn)槭艿胶５赘邏旱挠绊懗霈F(xiàn)了故障，尚堂跟周艇長(zhǎng)匯報(bào)，得到周艇長(zhǎng)指示后，開(kāi)始及時(shí)搶修。周艇長(zhǎng)安慰大家情緒道，五艙出現(xiàn)問(wèn)題就說(shuō)明801潛艇還有不足之處，但是大家要堅(jiān)定信心，相信身邊的戰(zhàn)友，相信國(guó)家，一定能完成好這次深潛任務(wù)。

隨著潛艇不斷深潛，已經(jīng)成功到達(dá)五號(hào)海域，此時(shí)尚堂已經(jīng)維修好五艙的液壓系統(tǒng)，鹿寧(韓宇辰 飾)通過(guò)聲吶發(fā)現(xiàn)海面上有不明艦體的航行噪音，周艇長(zhǎng)指揮潛艇繼續(xù)下潛，并發(fā)射魚(yú)雷干擾彈擊退不明艦體，過(guò)了片刻，鹿寧告訴大家，不明艦體已經(jīng)遠(yuǎn)離，眾人高興不已，801潛艇慢慢浮出海面。

周艇長(zhǎng)和盧一濤(高旻睿 飾)出了潛艇艙，站在潛艇上面，周艇長(zhǎng)問(wèn)盧一濤，看著大海他心中在想些什么，盧一濤如實(shí)說(shuō)，自己看著大海，就覺(jué)得一望無(wú)際，沒(méi)有邊界，周艇長(zhǎng)笑道，大海是有盡頭的，只要一直按照航線(xiàn)向前，盧一濤沉思片刻告訴周艇長(zhǎng)，自己現(xiàn)在只要看到大海，就會(huì)覺(jué)得呂艇長(zhǎng)還在自己身邊，周艇長(zhǎng)很欣慰盧一濤如此重情重義，也堅(jiān)信呂艇長(zhǎng)不會(huì)看錯(cuò)人，周艇長(zhǎng)告訴盧一濤，接下來(lái)的長(zhǎng)航將會(huì)考驗(yàn)大家的欲望和耐力，要盧一濤適時(shí)的將子晴給的錦囊妙計(jì)傳達(dá)給大家。

長(zhǎng)航第15天，姜耀(徐洋 飾)的情緒開(kāi)始不穩(wěn)定，韓冰洋(金禹伯 飾)目前狀態(tài)還很好，盧一濤安慰姜耀道，長(zhǎng)時(shí)間的航行焦躁是正常的，可是姜耀不愿意承認(rèn)自己焦躁，韓冰洋和盧一濤在旁邊鼓勵(lì)姜耀，進(jìn)入潛艇，所有人都是血脈相連的，他們是一個(gè)整體，不可分割。

時(shí)間繼續(xù)推移著，長(zhǎng)航進(jìn)入第二十五填，盧一濤發(fā)現(xiàn)席楠(袁布 飾)已經(jīng)一整天不吃東西了，他去跟政委匯報(bào)，政委說(shuō)長(zhǎng)時(shí)間航行厭食是正常現(xiàn)象，盧一濤將子晴交給他的第一個(gè)信封交給政委，政委讓盧一濤帶著席楠先去餐廳吧。晚飯時(shí)間，大家都聚集在餐廳，政委通過(guò)廣播向大家傳達(dá)了這段時(shí)間對(duì)大家艱苦耐勞精神的肯定，并說(shuō)自己為大家準(zhǔn)備了一份禮物，讓大家靜靜的聆聽(tīng)來(lái)自龍宮的深海之音，政委聲音落下，韓冰洋的琴聲隨著廣播徐徐傳出，悠揚(yáng)的旋律如同母親般溫柔的手，漸漸撫慰了大家焦躁的內(nèi)心，席楠聽(tīng)著音樂(lè)，覺(jué)得自己慢慢有了食欲，終于可以吃得下去飯了，盧一濤松了口氣。

長(zhǎng)航已經(jīng)五十天了，鹿寧已經(jīng)兩天兩夜不合眼了，尚堂問(wèn)他有沒(méi)有聽(tīng)過(guò)音樂(lè)，盧一濤無(wú)奈道韓冰洋的手都快拉斷了，可是什么效果都沒(méi)有，盧一濤決定拿出子晴的第二封信，信上只寫(xiě)了一個(gè)字：動(dòng)，盧一濤和尚堂理解了子晴的意思，于是帶著大家伙開(kāi)始做運(yùn)動(dòng)，運(yùn)動(dòng)使大家的身體得到了放松，鹿寧終于能閉上眼睛好好睡一覺(jué)了。

盧一濤和尚堂兩人還在較量著俯臥撐，最后尚堂還是不敵盧一濤，兩人累癱在地，盧一濤把最后一封信交給了尚堂，尚堂直問(wèn)他這么做會(huì)不會(huì)后悔，盧一濤說(shuō)出自己心里話(huà)，人生就是一個(gè)又一個(gè)的選擇，但是自己絕不后悔，尚堂打趣他說(shuō)以后要是自己和子晴有什么緊張，他可別后悔。

司令將金子晴(劉璐 飾)和沈文(滕砹 飾)叫到辦公室，說(shuō)這次長(zhǎng)航因?yàn)闂l件不允許所以沒(méi)有讓她們?nèi)?，現(xiàn)在讓他們?nèi)?01艇即將到達(dá)的目標(biāo)港口，在方舟號(hào)醫(yī)療船上為他們進(jìn)行一次全面的體檢和心理評(píng)估。兩人保證一定完成任務(wù)。

長(zhǎng)航九十天，當(dāng)周艇長(zhǎng)宣布了這個(gè)九十天已經(jīng)打破了中國(guó)海軍長(zhǎng)航的記錄時(shí)，大家興奮極了。周艇長(zhǎng)說(shuō)大家都承受了巨大的壓力，同樣的機(jī)器設(shè)備也是一樣的，越是這種極限的時(shí)候，機(jī)器設(shè)備出現(xiàn)故障的幾率就越大，需要大家繼續(xù)保持高度的警惕。

周艇長(zhǎng)宣布801艇即將停靠目標(biāo)港口進(jìn)行補(bǔ)給和維修，所有的官兵都將分批接受身體檢查和心里評(píng)估。高迪(張家鼎 飾)一高興，撞在桌子上把腦袋撞傷了。

在經(jīng)過(guò)了九十天的長(zhǎng)航后，大家終于第一次感受到了陽(yáng)光照耀在身上的溫暖。大家分開(kāi)進(jìn)行身體檢查。金子晴和盧一濤在電梯遇到，兩人坦然地相互問(wèn)好，盧一濤說(shuō)自己一切良好，子晴很欣慰。姜耀找到金子晴，說(shuō)自己這次長(zhǎng)航是一個(gè)很特別的體驗(yàn)，出發(fā)前先寫(xiě)好自己的遺書(shū)，明明自己還活在這個(gè)世界上，但是已經(jīng)安排好自己以后的生活。姜耀將自己和父母關(guān)系的不好的事情告訴了金子晴，說(shuō)自己發(fā)現(xiàn)最擔(dān)心的其實(shí)就是父母和小夏。金子晴讓他回去后就和父母和好，只要是他開(kāi)口，父母一定很高興的。金子晴找到尚堂，讓他等著晚上結(jié)束工作后來(lái)找自己。尚堂高興不已，被治療的醫(yī)生調(diào)侃。

鹿寧借口自己胸悶想要沈文給自己檢查一下，被韓冰洋不留情面的拆穿了。高迪躺在病床上，沈文來(lái)看他，兩人發(fā)現(xiàn)竟然是老鄉(xiāng)，相談甚歡，不料被習(xí)楠中途截胡，把沈文帶走了，高迪郁悶不已。習(xí)楠說(shuō)自己在長(zhǎng)航的最后都快忘了怎么表達(dá)了，但是現(xiàn)在就想把三個(gè)月都沒(méi)有說(shuō)的話(huà)全部說(shuō)完，沈文笑著說(shuō)洗耳恭聽(tīng)。